Работы основателя научной анатомии А. Везалия и открытие У. Гарвеем кровообращения (16—17 вв.), достижения патологической анатомии (Дж. Б. Морганьи , М. Ф. К. Биша , К. Рокитанский , Р. Вирхов , А. И. Полунин и др.), установившей локализацию и материальный субстрат болезней; разработка в 18—19 вв. методов расспроса (М. Я. Мудров , Г. А. Захарьин ), выстукивания (Л. Ауэнбруггер , Ж. Н. Корвизар ) и выслушивания (Р. Лаэннек , И. Шкода ) больного, а также экспериментального метода научного исследования (Ф. Мажанди , И. П. Мюллер ) создали предпосылки для развития Т. как естественнонаучной дисциплины. В середине 19 в. этому способствовала научная и клиническая деятельность терапевтов разных стран: Л. Tpaубе (Германия), А. Труссо (Франция), Р. Брайта и Т. Аддисона (Великобритания), Р. Оппольцера (Австрия) и т. д. Начатая работами Л. Пастера и Р. Коха «бактериологическая эра» в медицине (1870-е— 1890-е гг.) сопровождалась не только открытием возбудителей многих инфекционных заболеваний, но и резким преувеличением роли бактериального фактора в происхождении болезней вообще.
В борьбе с анатомо-локалистическим мышлением последователей целлюлярной патологии и недооценкой роли самого организма больного в патогенезе и процессах выздоровления формируется функциональное направление в Т., чему способствовали работы К. Вернара , И. М. Сеченова , основоположника научной Т. в России С. П. Боткина , И. П. Павлова , А. А. Остроумова , основоположника клинической кардиологии английского врача Дж. Макензи, немецкого терапевта Г. Бергмана и многих др. физиологов и клиницистов. Для этого направления характерны признание организма единым функциональным целым и аппарата нервной и эндокринной регуляции носителем этого единства; понимание болезни как реакции организма на повреждающее действие факторов среды, а нарушений функций органов и систем как определяющих её течение и исход; сочетание клинического наблюдения и эксперимента в научных исследованиях.
Физиологическое направление развивали Е. О. Мухин и И. Е. Дядьковский ; оно стало основой научного подхода школы Боткина к проблемам клинической патологии — это направление характерно для русской терапевтической школы. Другие типичные её черты — внимание к вопросам профилактической медицины, разработка клинического метода и критика умозрительных медицинских систем. Этими чертами отмечено развитие Т. в России, начиная с С. Г. Зыбелина и его последователей профессоров Московского университета Ф. Г. Политковского и М. Я. Мудрова; клинический метод Г. А. Захарьина получил мировое признание.
Достижения физики, технический прогресс и связанный с ним расцвет физиологии на рубеже 19—20 вв. обогатили Т. новыми инструментальными методами обследования больного и резко улучшили возможности врача в распознавании болезней. Особое значение имели открытие рентгеновских лучей и быстрое развитие рентгенодиагностики , введение электрокардиографии (голландский физиолог В. Эйнтховен. 1903) и бескровного метода определения артериального давления (итальянский учёный С. Рива-Роччи. 1896; русский врач Н. С. Коротков. 1905). Внедрению новых методов в диагностическую практику способствовала деятельность П. К. Потена, А. Вакеза во Франции, Ф. Крауса в Германии, К. Ф. Венкебаха в Австрии, Т. Льюиса в Великобритании, Дж. Парди в США, М. В. Яновского, В. Ф. Зеленина в России и многих др. клиницистов. С развитием химии связаны расширение диагностических возможностей с помощью различных методов лабораторного анализа (крови, мочи, желудочного содержимого и т. д.) и получение многих новых лекарственных средств. Успехи микробиологии и иммунологии привели к лечебно-профилактическому использованию вакцин и сывороток, возникновению серодиагностики , первые достижения которой связаны с именем французского терапевта Ф. Видаля. применившего её при брюшном тифе (1896).
В 19 в. начался обусловленный быстрым накоплением медицинских знаний процесс дифференциации клинической медицины: из всеобъемлющей Т. выделились в качестве самостоятельных дисциплин дерматология (1-я половина 19 в. — Р. Уиллен в Англии, Ж. Л. Алибер во Франции, Ф. Гебра ), невропатология (Ж. М. Шарко , 1860; А. Я. Кожевников , 1869), позднее — клиника инфекционных болезней, фтизиатрия и т. д. Для обозначения области собственно Т. вошёл в употребление термин «внутренние болезни», хотя многими клиницистами подчёркивались условность и неточность разделения болезней на внутренние и наружные.
К числу выдающихся зарубежных терапевтов конца 19 — начала 20 вв., создавших крупные школы, обогативших диагностику и лечение внутренних болезней, относятся А. Юшар (Франция), Э. Лейден, Б. Наунип, Э. Ромберг (Германия), У. Ослер, Дж. Б. Херрик (США) и многие др. Важный вклад русских и советских терапевтов в разработку диагностических методов — предложенные В. П. Образцовым глубокая скользящая пальпация ; М. И. Аринкиным — пункция грудины (1927) для изучения состояния костного мозга; С. С. Зимницким — проба, характеризующая функциональную способность почек. Основоположниками советской терапевтической школы были: М. П. Кончаловский, работы которого охватывали общие вопросы Т. (периодичность в течении болезней, предболезненные состояния и т. д.). патологию крови и органов пищеварения, ревматизм и др.; Г. Ф. Ланг, которому принадлежат приоритет в выделении и изучении гипертонической болезни (1922—48) и классификация болезней системы кровообращения (1935), ставшая основой их дальнейшего изучения в СССР; Д. Д. Плетнёв, развивавший клинико-экспериментальный метод в кардиологии, известный исследованиями нарушений ритма сердца, грудной жабы; Н. Д. Стражеско, который вместе с В. П. Образцовым дал первое классическое описание инфаркта миокарда (1909), выступил с концепцией стрептококковой этиологии ревматизма (1934), описал ряд признаков болезней органов кровообращения и пищеварения.
Проблемы современной терапии определяются изменением характера патологии, продолжающейся дифференциацией клинических дисциплин, широким внедрением лабораторно-инструментальных методов диагностики, особенностями лекарственной Т. В экономически развитых странах инфекционные болезни как ведущую форму патологии вытеснили сердечно-сосудистые заболевания — основная угроза здоровью и жизни человека; выяснению их природы, разработке эффективных мер борьбы с ними посвящено наибольшее количество исследований. Процесс ветвления Т., сопровождающийся интеграцией смежных областей Т. и, например, хирургии, урологии, физиологии, экспериментальных патологии и терапии, привёл во 2-й половине 20 в. к организационному оформлению в качестве самостоятельных научных разделов не только кардиологии, но и гастроэнтерологии, нефрологии и т. д.; в связи с этим всё более острой становится проблема общетерапевтической подготовки врача и интегрирующих исследований во внутренней медицине. Непрерывное расширение лабораторно-инструментального обследования больного сопровождается изучением вопросов машинной диагностики и в то же время всё настойчивее выдвигает проблему клинического мышления врача. Сульфаниламиды, антибиотики, гормональные препараты, цитостатические и психотропные средства, вакцины и сыворотки приравняли терапевта к хирургу, вооружённому скальпелем: их применение в большинстве случаев вызывает выраженный лечебный эффект, но может сопровождаться осложнениями, в связи с чем возникли понятие «лекарственные болезни» и необходимость тщательного изучения новых лекарственных средств, их оптимальной дозировки и возможного отрицательного действия, стала развиваться клиническая фармакология.